El Instituto Chacabuco es un Colegio Católica de Iglesia que ilumina su proceso educativo desde el mensaje del Evangelio. Por tal razón, la presencia de Dios, la Buena Madre y San Marcelino Champagnat, están presentes en cada espacio y rincón colegial.

El colegio cuenta con dos Capillas. Capilla de Educación Básica en el patio de 1° y 2° Básicos, y la capilla de Educación Media, en el patio de Media Inicial.

Se trata de espacios espirituales en donde está presente el encuentro personal y comunitario con Dios, realizando encuentros de oración y con Cristo, misas por cursos semanales, mes de María, rezo diario del Santo Rosario.

Capilla de Sección Básica: está especialmente adecuada y preparada para acoger a los más pequeños de la sección con cuadros especiales de San Marcelino y la Buena Madre. Teniendo una capacidad para 80 personas.

Capilla de Sección Media: está preparada para recibir alrededor de 80 personas, en la que todos los días se realiza el Santo Rosario.

Las capillas están siempre disponibles para el uso de la comunidad educativa, en ellas podemos ver en recreos alumnos en oración y visita al Santísimo expresando su cariño y amor a Dios.